生物多样性是衡量一个地区生态环境质量的重要标志，鸟类是生态系统中的重要组成部分，因其具有对环境变化敏感，而常被作为反映一个地区生物多样性和生态环境的指示物种。

2023年3月-2024年2月太统-崆峒山国家级自然保护区采用固定距离样线法和分层随机抽样方法，在保护区内共布设样线30条，覆盖农田、灌丛、村庄、湿地、林地等多种生境。每条样线长度1-2 km，两条样线间距离500 m以上。调查共记录到鸟类17目51科176种，个体数3175只，其中雀形目鸟种数最多，有113种，其次为鸻形目有11种，被列入《国家重点保护野生动物名录》有26种。科中鹟科鸟种数最多，有14种，其次为柳莺科，有11种；国家一级重点保护野生动物3种，包括秃鹫、黑鹳、金雕；国家二级重点保护野生动物23种；被列入《有重要生态、科学、社会价值的陆生野生动物名录》有150种；被列入《濒危野生动植物种国际贸易公约》附录的有17种，被IUCN红色名录列为受威胁（极危、濒危、易危）有1种，为蓝翡翠；另有11个种为中国特有种。

甘肃太统-崆峒山国家级自然保护区复杂多样的自然地貌孕育了丰富的生物多样性资源。近年来，保护区管理机构多措并举，妥善处理人与自然之间的冲突，平衡开发与保护之间的矛盾，不断优化自然资源管理，加强鸟类群落动态监测和数据积累，为科学规范管理保护区奠定了扎实基础。